Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf18Q7TS55 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf18Q7TS55 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms