Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smap2Q7TN29 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smap2Q7TN29 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smap2Q7TN29 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms