Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HhipQ7TN16 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HhipQ7TN16 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HhipQ7TN16 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HhipQ7TN16 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms