Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox11Q7M6Y2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox11Q7M6Y2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox11Q7M6Y2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox11Q7M6Y2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms