Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcl2Q78Y63 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcl2Q78Y63 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdcl2Q78Y63 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl2Q78Y63 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms