Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sys1Q78S06 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sys1Q78S06 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sys1Q78S06 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms