Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eci3Q78JN3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eci3Q78JN3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms