Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12aQ78HU3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mvb12aQ78HU3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12aQ78HU3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12aQ78HU3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12aQ78HU3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12aQ78HU3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mvb12aQ78HU3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mvb12aQ78HU3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mvb12aQ78HU3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mvb12aQ78HU3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.4 ms