Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ssh1Q76I79 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssh1Q76I79 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ssh1Q76I79 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ssh1Q76I79 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms