Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup188Q6ZQH8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nup188Q6ZQH8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nup188Q6ZQH8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nup188Q6ZQH8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms