Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Topbp1Q6ZQF0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Topbp1Q6ZQF0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms