Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NinlQ6ZQ12 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NinlQ6ZQ12 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NinlQ6ZQ12 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
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