Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LcorQ6ZPI3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LcorQ6ZPI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LcorQ6ZPI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms