Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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