Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc154Q6RUT8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc154Q6RUT8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc154Q6RUT8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc154Q6RUT8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms