Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGH0

Ubtd2, Ubiquitin domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd2Q6PGH0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubtd2Q6PGH0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubtd2Q6PGH0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubtd2Q6PGH0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubtd2Q6PGH0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubtd2Q6PGH0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubtd2Q6PGH0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ubtd2Q6PGH0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubtd2Q6PGH0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubtd2Q6PGH0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubtd2Q6PGH0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ubtd2Q6PGH0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubtd2Q6PGH0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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