Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmeff1Q6PFE7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmeff1Q6PFE7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmeff1Q6PFE7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmeff1Q6PFE7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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