Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim37Q6PCX9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim37Q6PCX9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim37Q6PCX9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms