Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcrQ6PAJ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BcrQ6PAJ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcrQ6PAJ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms