Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpa4Q6P8K8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpa4Q6P8K8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpa4Q6P8K8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms