Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RbfaQ6P3B9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RbfaQ6P3B9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms