Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pprc1Q6NZN1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pprc1Q6NZN1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pprc1Q6NZN1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pprc1Q6NZN1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pprc1Q6NZN1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Pprc1Q6NZN1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pprc1Q6NZN1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pprc1Q6NZN1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pprc1Q6NZN1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms