Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23ipQ6NZC7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23ipQ6NZC7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec23ipQ6NZC7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23ipQ6NZC7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms