Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krba1Q6NXZ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krba1Q6NXZ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krba1Q6NXZ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms