Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Ltv1Q6NSQ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltv1Q6NSQ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ltv1Q6NSQ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ltv1Q6NSQ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms