Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pdcd11Q6NS46 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Pdcd11Q6NS46 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pdcd11Q6NS46 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pdcd11Q6NS46 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Pdcd11Q6NS46 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pdcd11Q6NS46 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms