Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CltbQ6IRU5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltbQ6IRU5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltbQ6IRU5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms