Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm4Q6IRU2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm4Q6IRU2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm4Q6IRU2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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