Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp4Q68FH0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp4Q68FH0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp4Q68FH0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms