Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4fQ66X05 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4fQ66X05 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4fQ66X05 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms