Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q66JV7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q66JV7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q66JV7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q66JV7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q66JV7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q66JV7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q66JV7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q66JV7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q66JV7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q66JV7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q66JV7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q66JV7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q66JV7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q66JV7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q66JV7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q66JV7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q66JV7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q66JV7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q66JV7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q66JV7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q66JV7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q66JV7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q66JV7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q66JV7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q66JV7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q66JV7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Q66JV7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q66JV7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Q66JV7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q66JV7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q66JV7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q66JV7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q66JV7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q66JV7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q66JV7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q66JV7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Q66JV7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q66JV7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q66JV7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q66JV7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q66JV7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q66JV7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q66JV7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q66JV7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q66JV7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q66JV7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q66JV7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q66JV7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q66JV7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q66JV7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q66JV7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q66JV7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q66JV7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q66JV7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q66JV7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q66JV7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q66JV7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q66JV7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q66JV7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q66JV7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q66JV7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q66JV7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q66JV7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q66JV7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q66JV7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q66JV7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q66JV7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q66JV7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q66JV7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms