Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8eQ66JT1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8eQ66JT1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8eQ66JT1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8eQ66JT1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8eQ66JT1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8eQ66JT1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8eQ66JT1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrc8eQ66JT1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc8eQ66JT1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc8eQ66JT1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms