Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp2a3Q64518 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2a3Q64518 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms