Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gja3Q64448 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gja3Q64448 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gja3Q64448 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gja3Q64448 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms