Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CochQ62507 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CochQ62507 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CochQ62507 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CochQ62507 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CochQ62507 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CochQ62507 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CochQ62507 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CochQ62507 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CochQ62507 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CochQ62507 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CochQ62507 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CochQ62507 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CochQ62507 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CochQ62507 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CochQ62507 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CochQ62507 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CochQ62507 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CochQ62507 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CochQ62507 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CochQ62507 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CochQ62507 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CochQ62507 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CochQ62507 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CochQ62507 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CochQ62507 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CochQ62507 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CochQ62507 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CochQ62507 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CochQ62507 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CochQ62507 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CochQ62507 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CochQ62507 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CochQ62507 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CochQ62507 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CochQ62507 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CochQ62507 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CochQ62507 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CochQ62507 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CochQ62507 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CochQ62507 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CochQ62507 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CochQ62507 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CochQ62507 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CochQ62507 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CochQ62507 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CochQ62507 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CochQ62507 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CochQ62507 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CochQ62507 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CochQ62507 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CochQ62507 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CochQ62507 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CochQ62507 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CochQ62507 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CochQ62507 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CochQ62507 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CochQ62507 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CochQ62507 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CochQ62507 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CochQ62507 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CochQ62507 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CochQ62507 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CochQ62507 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CochQ62507 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CochQ62507 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CochQ62507 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CochQ62507 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CochQ62507 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CochQ62507 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CochQ62507 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CochQ62507 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CochQ62507 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CochQ62507 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CochQ62507 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CochQ62507 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CochQ62507 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CochQ62507 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CochQ62507 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CochQ62507 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CochQ62507 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CochQ62507 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CochQ62507 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CochQ62507 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CochQ62507 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CochQ62507 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CochQ62507 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CochQ62507 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CochQ62507 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CochQ62507 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CochQ62507 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CochQ62507 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CochQ62507 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CochQ62507 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CochQ62507 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CochQ62507 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CochQ62507 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CochQ62507 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CochQ62507 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CochQ62507 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms