Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps72Q62481 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps72Q62481 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms