Protein–RNA interactions for Protein: Q62421

Sh3gl3, Endophilin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl3Q62421 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3gl3Q62421 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3gl3Q62421 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl3Q62421 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms