Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TrhQ62361 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TrhQ62361 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TrhQ62361 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrhQ62361 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TrhQ62361 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TrhQ62361 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TrhQ62361 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TrhQ62361 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TrhQ62361 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TrhQ62361 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TrhQ62361 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms