Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema5aQ62217 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5aQ62217 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms