Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifi47Q61635 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifi47Q61635 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms