Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms