Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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