Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Foxd1Q61345 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Foxd1Q61345 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Foxd1Q61345 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Foxd1Q61345 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms