Protein–RNA interactions for Protein: Q61288

Acvrl1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvrl1Q61288 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acvrl1Q61288 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acvrl1Q61288 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acvrl1Q61288 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms