Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcp1Q61233 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Lcp1Q61233 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcp1Q61233 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms