Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gata6Q61169 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gata6Q61169 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gata6Q61169 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms