Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lamb3Q61087 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamb3Q61087 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamb3Q61087 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms