Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JrkQ60976 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JrkQ60976 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JrkQ60976 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JrkQ60976 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
JrkQ60976 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JrkQ60976 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JrkQ60976 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JrkQ60976 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrkQ60976 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
JrkQ60976 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JrkQ60976 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms