Protein–RNA interactions for Protein: Q60967

Papss1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papss1Q60967 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Papss1Q60967 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Papss1Q60967 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Papss1Q60967 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Papss1Q60967 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms