Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a4Q60857 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245 ms